Good morning,
 
I'm aware of 3 lists of Sanskrit suffixes:
Whitney (Уитни) 1879, 
Debrunner (Дебруннер) 1954
Harkare (Харкаре) 1983
 
Have I missed something? Our list has 305 pratyayas.
 
So what can we see? 20 most frequent Sanskrit suffixes (ā, ya, ra, ta, ana, aka, ti, ita, va, ika, tra, tā, ma, śa, as, tha, la, ala, u, tva) cover 80% of all scanned Sanskrit texts.
 
M.
 
P.S.  The reverse list:
-#-    №1
-a-    №2
-a-    №3
-a-    №4
-a-    №5
-ā-    №45
-ā-    №46
-ā-    №47
-ā-    №44
-i-    №60
-i-    №61
-i-    №62
-i    №63
-ī-    №95
-ī-    №93
-ī-    №94
-u-    №108
-u-    №107
-u-    №106
-ū    №115
-ṛ     №117
-e    №118
-o-    №122
-ka-    №124
-ka-    №123
-aka-    №6
-ika-    №64
-īka-    №96
-uka-    №109
-cha-    №128
-iṣṭha-    №87
-iṣṭha-    №88
-ta-    №130
-ata-    №12
-ita-    №66
-tha-    №179
-atha-    №16
-ūtha-    №116
-dha    №187
-na-    №196
-na-    №197
-na-    №195
-ana-    №20
-āna-    №51
-āna-    №50
-ina-    №77
-īna-    №97
-īna-    №98
-una-    №110
-tana-    №132
-tvana-    №175
-māna-    №220
-māna-    №221
-māna-    №222
-tna-    №163
-mna-    №226
-ma-    №210
-ma-    №211
-ma-    №212
-ima-    №78
-tama-    №134
-tama-    №133
-ya-    №235
-ya-    №234
-ya-    №233
-ya-    №232
-ya-    №229
-ya-    №236
-ya-    №231
-ya    №230
-aya-    №35
-aya-    №36
-aya-    №37
-āya-    №55
-āya-    №54
-iya-    №81
-īya-    №101
-eya-    №121
-taya-    №135
-naya-    №198
-paya-    №208
-maya-    №219
-laya-    №257
-saya-    №296
-tvāya    №177
-anīya-    №26
-tya    №166
-tya-    №165
-tya-    №167
-enya-    №119
-enya-    №120
-āyya-    №56
-āyya-    №57
-tayya    №137
-tavya-    №146
-iṣya-    №91
-sya-    №304
-ra    №250
-ra-    №248
-ra-    №249
-ira-    №82
-ura-    №111
-tara-    №139
-tara-    №140
-vara    №275
-sara-    №298
-tra-    №170
-tra    №171
-atra-    №15
-itra-    №72
-la-    №256
-la-    №255
-ala-    №40
-āla-    №58
-ila-    №83
-ula-    №112
-vala-    №277
-va-    №261
-tva-    №173
-tva-    №174
-śa-    №284
-iṣa-    №85
-iṣa-    №86
-īṣa-    №104
-sa-    №292
-sa-    №293
-sa-    №291
-ha-    №305
-kā-    №125
-akā-    №7
-ikā-    №65
-tā-    №150
-tā    №149
-thā    №181
-dā    №184
-dhā    №188
-nā-    №200
-nā-    №201
-anā-    №21
-yā-    №243
-yā    №242
-tyā    №168
-rā-    №251
-trā    №172
-lā-    №258
-tvā    №176
-itvā    №73
-sā-    №300
-ti-    №154
-ti-    №157
-ti-    №156
-ti-    №155
-ati-    №13
-śati-    №286
-tāti-    №153
-thi-    №182
-di    №186
-ni-    №202
-ani    №24
-ani-    №23
-ani-    №22
-mani    №216
-vani-    №268
-sani    №295
-mi-    №223
-mi-    №224
-ri-    №252
-tari    №143
-vi-    №282
-rhi    №254
-akī-    №8
-tī-    №158
-nī-    №204
-nī-    №203
-anī-    №25
-ānī-    №52
-varī-    №276
-tvī    №178
-itvī    №74
-iṣṇu-    №90
-iṣṇu-    №89
-tu-    №160
-tu-    №159
-athu-    №17
-nu-    №205
-nu-    №206
-anu-    №28
-anu-    №27
-vanu-    №269
-tnu-    №164
-atnu-    №14
-itnu-    №70
-itnu-    №71
-snu-    №303
-yu-    №245
-ru-    №253
-su-    №302
-mane    №217
-vane    №270
-aye    №38
-taye    №136
-tave    №145
-itave    №68
-ase    №43
-tyai    №169
-dhyai    №189
-tavai    №144
-itavai    №67
-no-    №207
-c-    №127
-ac-    №9
-añc-    №10
-t-    №129
-at-    №11
-āt-    №48
-vat-    №262
-vat    №263
-vat-    №264
-śat-    №285
-tāt-    №152
-tāt    №151
-ant-    №31
-ant-    №29
-ant-    №30
-ānt-    №53
-mant-    №218
-yant-    №239
-vant-    №272
-vant-    №271
-vant-    №273
-n-    №194
-n-    №191
-n-    №190
-n-    №193
-n-    №192
-an-    №18
-an-    №19
-ān-    №49
-in-    №76
-in-    №75
-tan-    №131
-man-    №214
-man-    №215
-man-    №213
-iman-    №80
-iman-    №79
-īman-    №99
-van-    №266
-van-    №267
-van-    №265
-san-    №294
-vān-    №281
-min-    №225
-vin-    №283
-āvin-    №59
-m    №209
-am    №34
-am    №32
-am    №33
-tham    №180
-dam    №183
-taram    №141
-tarām    №142
-dānīm    №185
-tum    №161
-itum    №69
-y-    №227
-y-    №228
-īy-    №100
-r-    №247
-r    №246
-ar-    №39
-tar-    №138
-var-    №274
-sar-    №297
-v-    №260
-v-    №259
-iṣ-    №84
-siṣ-    №301
-s    №288
-s-    №289
-s-    №290
-as    №41
-as-    №42
-is-    №92
-īs-    №105
-us-    №113
-us-    №114
-tas-    №148
-tas    №147
-nas-    №199
-yas-    №241
-yas-    №240
-īyas-    №103
-vas-    №278
-vas-    №279
-kṛtvas    №126
-śas    №287
-sas-    №299
-yās-    №244
-tos    №162
-yaṁs-    №238
-yaṁs-    №237
-īyaṁs-    №102
-vāṁs-    №280